下列疾病可能出现头痛，但是尚无充分的证据证实：
失眠、肾上腺皮质功能不足、盐皮质激素缺乏、醛固酮增多症、红细胞增多症、高粘滞血症、血小板减少性紫癜、血浆置换、抗心磷脂抗体综合征、Cushing’s 病、低钠血症、甲亢、高糖血症、高钙血症、系统性红斑狼疮、慢性疲劳综合征、纤维肌痛综合征。
仍需要前瞻性的严格对照研究来明确定义和这些系统疾病相关头痛的发病率及其头痛特点。每一种情况，只能对于那些有明确符合诊断标准的疾病才能纳入。